Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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