Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms