Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms