Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx18Q91ZR2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms