Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubtd1Q91WB7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms