Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RestQ8VIG1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RestQ8VIG1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms