Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng8Q8VHW2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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