Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6lQ8VEG6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms