Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d2Q8VD57 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d2Q8VD57 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms