Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam20bQ8VCS3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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