Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nae1Q8VBW6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nae1Q8VBW6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nae1Q8VBW6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nae1Q8VBW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nae1Q8VBW6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms