Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SdsQ8VBT2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SdsQ8VBT2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms