Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms