Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc12Q8R344 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms