Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms