Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rdh16f2Q8K3M1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rdh16f2Q8K3M1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rdh16f2Q8K3M1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh16f2Q8K3M1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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