Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms