Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms