Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsl1Q8K305 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsl1Q8K305 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms