Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stn1Q8K2X3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms