Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Paf1Q8K2T8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms