Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fbxo18Q8K2I9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms