Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd3Q8K2F0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms