Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkd3Q8K1Y2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms