Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms