Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CopaQ8CIE6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms