Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF02

Fam25c, Protein FAM25C, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam25cQ8CF02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam25cQ8CF02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam25cQ8CF02 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms