Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef8Q8CE24 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.6 ms