Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms