Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms