Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E4f1Q8CCE9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms