Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dctn4Q8CBY8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dctn4Q8CBY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms