Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf170Q8CBG9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms