Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrn3Q8CBC6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn3Q8CBC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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