Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fbxo48Q8CAT8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms