Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwc2Q8C8N3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms