Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cwc22Q8C5N3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc22Q8C5N3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
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