Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms