Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a2Q8BY89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a2Q8BY89 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms