Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc12Q8BW49 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms