Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms