Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efemp1Q8BPB5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms