Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nmes1Q810Q5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms