Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Smim19Q80ZU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim19Q80ZU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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