Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms