Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc155Q80VJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms