Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms