Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otop3Q80UF9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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