Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef17Q80U35 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef17Q80U35 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms