Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IfnkQ7TSL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IfnkQ7TSL0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms